Как и любое другое рентгенологическое исследование, компьютерная томография брюшной полости не лишена рисков. Хотя они довольно редки, риски включают контраст-индуцированную нефропатию и контраст-индуцированную аритмию, особенно у пациентов с сердечными заболеваниями. Более серьезным, но все же довольно редким осложнением является контраст-индуцированный нефроз. Это состояние, которое может привести к почечной недостаточности и в некоторых случаях приводит к летальному исходу. Другим потенциальным риском является инфекция, особенно в области катетера, который был установлен пациенту для внутривенного (IV) контрастного вещества. Риск заражения выше у пациентов со слабой иммунной системой, например, у тех, кто недавно перенес трансплантацию органов или химиотерапию, или у тех, кто уже страдает от инфекции во время теста.